La partie "cœur de gare" du projet et sa mezzanine ont coûté 58M€. Elle est cofinancée par l'Union européenne via le fonds européen de développement régional (Feder) à hauteur de 2,1M€ ; l'Etat (3,8M€); la région Pays-de-la-Loire, le plus gros contributeur (28,5M€) ; le département de Loire-Atlantique (2,1M€) ; Nantes métropole (7,4M€) ; et SNCF Gares & Connexion (14,1M€).
En complément, il faut ajouter environ 9M€ pour les aménagements ferroviaires, comme les dévoiements de caténaires, la pose de heurtoirs, etc. Et en tenant compte de l'ensemble de l'aménagement du pôle d'échange multimodal, avec notamment l'aménagement des parvis le projet s'élève à 132,5M€. Tout compris, Nantes métropole est le contributeur le plus important (42,9M€), suivi de la région (38,95M€), Gares et Connexions (14,89M€), le département (11M€), l'Etat (10,3M€), l'Union européenne (9,93M€) et enfin SNCF Réseau (4,53M€).
Ile de Nantes : trois projets viennent compléter la Prairie-au-Duc
